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Le scuole equestri non sono indenni da numerosi abusi e problemi legati alla salute e al benessere dei cavalli, perché lavorano con fantini diversi, con diversi livelli di abilità. Le cause di questi problemi dovrebbero includere anche il tempo insufficiente nei pascoli e l'età avanzata del cavallo ed inoltre - cosa può essere più sorprendente - l'età e l'esperienza dei proprietari delle scuole e la formazione degli istruttori. Quando si tratta di manager e istruttori, l'educazione continua e l'esperienza di apprendimento sembrano essere la chiave per mantenere i cavalli in buona salute.
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Tuttavia, l'impatto maggiore sulla salute dei cavalli in questo tipo di istituzioni è l'esperienza lavorativa. Più tempo passano i cavalli in passerella senza lavorare, meno sono esposti alle lesioni e hanno meno problemi di salute. Anche l'età di un cavallo influisce sulla sua salute, ed i cavalli più anziani, in media, non lavorano meno di quelli più giovani. Certo, a volte capita che i cavalli più anziani lavorano meno; dipende dalle condizioni del cavallo.
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Il problema più grande che porta a pause nel lavoro dei cavalli è la zoppia; quasi il 70% dei giorni non lavorativi derivava dalla zoppia. Le cause meno comuni includono coliche, problemi comportamentali, malattie della pelle, l'asma e RAO. I cavalli che a causa di problemi fisici sono costretti a lunghe pause da lavoro sono di solito inviati al macello. Tuttavia, i problemi psicologici sono la ragione principale per cui le scuole equestri si liberano dei cavalli. Circa l'80% dei centri equestri ha rivenduto l'animale o l'ha mandato al macello a causa di problemi comportamentali. Altri motivi per la macellazione erano la zoppia, la malattia respiratoria e le crescenti spese per la manutenzione del cavallo.